运营工商资质注册办理网站的开发方案是一个综合性的项目，涉及到需求分析、系统设计、技术选型、开发实施以及后期运营等多个环节。以下是一个详细的开发方案：

一、需求分析

1. 确定目标用户群体：明确网站的主要受众，包括企业、个体工商户、创业者等，以便为他们提供精准的工商资质注册办理服务。

2. 梳理功能需求：根据目标用户群体的需求，梳理出网站需要实现的核心功能，如在线申请、资质查询、进度跟踪、在线支付、客服咨询等。

3. 考虑用户体验：关注网站的易用性、可访问性和安全性，确保用户能够便捷地使用网站完成各项操作。

二、系统设计

1. 网站架构设计：采用稳定可靠的架构方案，确保网站在高并发访问下的性能表现。

2. 数据库设计：设计合理的数据库结构，存储用户信息、资质信息、申请记录等数据，确保数据的安全性和一致性。

3. 界面设计：根据目标用户群体的特点，设计简洁、易用的界面，提高用户体验。

三、技术选型

1. 前端技术：采用响应式设计，确保网站在不同设备上的兼容性；使用前端框架，提高开发效率。

2. 后端技术：选择稳定可靠的后端开发语言和技术栈，确保网站的性能和安全性。

3. 数据库技术：选用成熟的数据库管理系统，确保数据的存储和查询效率。

四、开发实施

1. 搭建开发环境：配置开发所需的服务器、数据库等环境，确保开发过程的顺利进行。

2. 编写代码：按照系统设计和功能需求，编写前后端代码，实现各项功能。

3. 测试与调试：对网站进行详细的测试和调试，确保各项功能的正常运行和用户体验的完善。

五、后期运营

1. 维护与更新：定期对网站进行维护和更新，确保网站的稳定性和安全性。

2. 数据分析与优化：根据用户行为数据，分析网站的使用情况，对功能进行优化和改进。

3. 推广与营销：制定有效的推广策略，提高网站的知名度和影响力，吸引更多的用户使用。

运营工商资质注册办理网站的开发方案需要从多个方面进行考虑和规划，确保网站的稳定性、安全性和用户体验。同时，还需要根据市场变化和用户需求的变化，及时调整和优化网站的功能和服务。