独立站运营中是否需要缴纳手续费的问题，主要涉及交易过程中产生的费用。通常情况下，独立站不需要缴纳类似于平台使用费的手续费，但可能会涉及到支付渠道的费率。具体是否需要缴纳，需根据所选择的支付方式和第三方服务来确定。